C-Phasing

Phasing and scaffolding polyploid genomes based on Pore-C, HiFi-C, Ultra-long, or Hi-C data

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介绍¶

使用Hi-C数据实现多倍体基因组分型挂载，存在主要问题之一是大量不明确的短读长比对，这容易导致高水平的交换或嵌合组装错误。现在，基于长读长的染色体构象捕获技术，如Pore-C、HiFi-C，为克服这一问题提供了有效途径。在这里，我们开发了一个新的流程，即“C-Phasing”，它是专门为多倍体分型组装量身定制的，旨在充分利用Pore-C或HiFi-C数据的优势。此外，它也可用于Hi-C或Micro-C等基于二代的染色质构象捕获技术产生的数据和二倍体基因组组装。

C-Phasing的优势:
- 快速.
- 更高的挂载率.
- 更高的分型组装质量.

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